Index

_

__eq__() (bedContainer.BedContainer.BedContainer method) (bedContainer.BedContainer6.BedContainer6 method) (bedEntry.BedEntry.BedEntry method) (bedEntry.BedEntry6.BedEntry6 method) __getitem__() (bedContainer.BedContainer.BedContainer method) (bedContainer.BedContainer6.BedContainer6 method) __init__() (bedContainer.BedContainer.BedContainer method) (bedContainer.BedContainer6.BedContainer6 method) (bedEntry.BedEntry.BedEntry method) (bedEntry.BedEntry6.BedEntry6 method)

__iter__() (bedContainer.BedContainer.BedContainer method) (bedContainer.BedContainer6.BedContainer6 method) __len__() (bedContainer.BedContainer.BedContainer method) (bedContainer.BedContainer6.BedContainer6 method) (bedEntry.BedEntry.BedEntry method) (bedEntry.BedEntry6.BedEntry6 method) __str__() (bedContainer.BedContainer.BedContainer method) (bedContainer.BedContainer6.BedContainer6 method) (bedEntry.BedEntry.BedEntry method) (bedEntry.BedEntry6.BedEntry6 method)

A

addExtraField() (bedEntry.BedEntry.BedEntry method) (bedEntry.BedEntry6.BedEntry6 method) addFrom_BedEntryObj() (bedContainer.BedContainer.BedContainer method) (bedContainer.BedContainer6.BedContainer6 method)

addFrom_List() (bedContainer.BedContainer.BedContainer method) (bedContainer.BedContainer6.BedContainer6 method)

B

BedContainer (class in bedContainer.BedContainer) BedContainer6 (class in bedContainer.BedContainer6)

BedEntry (class in bedEntry.BedEntry) BedEntry6 (class in bedEntry.BedEntry6)

C

chr (bedEntry.BedEntry.BedEntry attribute) (bedEntry.BedEntry6.BedEntry6 attribute)

E

eCoord (bedEntry.BedEntry.BedEntry attribute) (bedEntry.BedEntry6.BedEntry6 attribute) empty() (bedContainer.BedContainer.BedContainer method) (bedContainer.BedContainer6.BedContainer6 method)

extraFields (bedEntry.BedEntry.BedEntry attribute) (bedEntry.BedEntry6.BedEntry6 attribute)

H

hasExtraFields() (bedEntry.BedEntry.BedEntry method) (bedEntry.BedEntry6.BedEntry6 method)

I

isOverlapping() (bedEntry.BedEntry.BedEntry method) (bedEntry.BedEntry6.BedEntry6 method)

L

lenExtraFields() (bedEntry.BedEntry.BedEntry method) (bedEntry.BedEntry6.BedEntry6 method)

M

merge() (bedContainer.BedContainer.BedContainer static method) (bedContainer.BedContainer6.BedContainer6 static method)

N

number_EntriesInChr() (bedContainer.BedContainer.BedContainer method) (bedContainer.BedContainer6.BedContainer6 method)

R

readFromBedFile() (bedContainer.BedContainer.BedContainer method) (bedContainer.BedContainer6.BedContainer6 method)

removeEntryBed() (bedContainer.BedContainer.BedContainer method) (bedContainer.BedContainer6.BedContainer6 method)

S

sCoord (bedEntry.BedEntry.BedEntry attribute) (bedEntry.BedEntry6.BedEntry6 attribute) select_Chromosomes() (bedContainer.BedContainer.BedContainer method) (bedContainer.BedContainer6.BedContainer6 method)

select_EntriesInChr() (bedContainer.BedContainer.BedContainer method) (bedContainer.BedContainer6.BedContainer6 method) sort() (bedContainer.BedContainer.BedContainer method) (bedContainer.BedContainer6.BedContainer6 method)

W

writeToBedFile() (bedContainer.BedContainer.BedContainer method) (bedContainer.BedContainer6.BedContainer6 method)